Son amour est le romantisme allemand, et au centre de son travail sont des opéras et des œuvres orchestrales de Richard Wagner, Richard Strauss, Erich Wolfgang Korngold, Franz Liszt et Robert Schumann, mais aussi Ludwig van Beethoven. Tout aussi important pour lui est l'examen sérieux de la soi-disant « muse de la lumière », les opérettes, les valses et les polkas de l'époque des opérettes d'or et d'argent.
Les œuvres pour piano de Ludwig van Beethoven sont l'étoile centrale du répertoire de Matthias Fletzberger en tant que pianiste. Ses interprétations virtuoses des œuvres de Liszt et de Schumann, des œuvres complètes de Ravel et surtout des « Trois mouvements de Pétrouchka » de Stravinsky sont également connues.
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